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Blog

Wir zeigen dir hier wöchentlich den Projektfortschritt, du kannst das Team hinter dem Projekt kennenlerenen und “behind the scenes” Einblicke in unseren Laboralltag gewinnen. Wenn dir irgendwas unklar ist, schau doch mal in unsere Hintergrundwissen-Sektion, oder schreib uns einfach eine Mail mit deiner Frage. Alternativ kannst du uns auch auf Instagram folgen und uns dort kontaktieren. 

 

Das gute Wetter am Wochenende haben Sophie und Kora ausgenutzt, um Bilder für unsere Social-Media Auftritte zu generieren. Die starten nämlich bald - also stell sicher, dass du uns auch folgst! Unseren Insta-Account findest du in der Seitenleiste verlinkt. 

Kora und Carl-Eric haben vergangene Woche die erste PCR (englisch: Polymerase Chain Reaction) im Labor gemacht. Dabei wird die DNA in den Bodenproben genommen, und spezifisch nur das xoxF Gen vermehrt, das für das SEE-nutzende Enzym MDH codiert. 

Wenn das PCR-Produkt in ein Agarosegel geladen wird und 45min bei 80 V in einer Gelelektrophoresekammer unter Spannung liegt, teilt sich die DNA ihrer Größe nach in unterschiedliche Banden auf. Die Größe des xoxF Gens ist bekannt, sodass wir die Banden dem Gen zuweisen können. Können wir nach der Belichtung eine dicke Bande der richtigen DNA-Größe im Agarosegel erkennen, wissen wir, dass in der Bodenprobe das xoxF Gen enthalten war (das sieht dann so ähnlich aus wie im Foto vom letzten Eintrag). 

Im nächsten Schritt kann man die Anzahl an Bakterien mit xoxF Gen dann auch quantifizieren - für uns steht das nächste Woche an. Wenn man im Gel dagegen nichts erkennt, kann man ausschließen, dass im Boden SEE-nutzende Bakterien lebten. 

Erste Analysen

Die in der Winterpause gesammelten Proben sind bereit für erste Analysen. Dabei hat Kora in einem mehrschrittigen Prozess die Bodenproben erst sehr klein zermüllert, sodass die darin enthaltenen Zellen aufbrechen und die DNA freigeben. Dann hat sie die DNA aus dem Boden extrahiert, und in einem Agarosegel per Gelelektrophorese sichtbar gemacht. 

Nächste Woche wird sie dann eine PCR (englisch: Polymerase Chain Reaction) laufen lassen. Bei einer PCR kann man Gene, für die auf der DNA codiert sind, vervielfältigen. 

Kick-off meeting

Am vorletzten Mittwoch im Dezember hatten wir unser erstes Projektmeeting. Dabei haben wir erstmal organisatorische Details und Fragestellungen besprochen: wie gestalten wir unsere mediale Präsenz? Wie können wir die Motivation und die Lernkurve von Teilnehmenden beobachten? Welche Probenaufbereitungsschritte brachen wir für die Proben im Labor?

Um Schritt für Schritt festen Fuß im Projekt zu fassen, haben wir beschlossen, über die Winterpause selbst Proben zu nehmen und diese dann im Labor zu analysieren. Auf den Fotos oben kann man Kora dabei, wie sie eine Probe im Volksgarten in Düsseldorf nimmt.